二十四節(jié)氣不僅僅代表著日月運行位置和天氣、動植物生長等自然現(xiàn)象，它還代表著華國數(shù)千年的文化精髓，以及華國人骨子里的底蘊。小神醫(yī)四季一個聰明伶俐的小蘿莉，和活波可愛的熊貓咪嘟嘟，當兩個小可愛遇見傳統(tǒng)的二十四節(jié)氣，會不會帶給我們一個不一樣的華國傳統(tǒng)文化呢？

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機，因為中醫(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監(jiān)督者。

故事講述了個性開朗喜歡搗亂的小學(xué)生布丁，和性格有點暴躁的黃連，倆人的日常校園生活故事。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。